高新技術企業(yè)認定的程序如下：
（一）企業(yè)自我評價及申請
企業(yè)登錄“高新技術企業(yè)認定管理工作網”，對照本辦法第十條規(guī)定條件，進行自我評價。認為符合認定條件的，企業(yè)可向認定機構提出認定申請。
（二）提交下列申請材料
1.高新技術企業(yè)認定申請書；
2.企業(yè)營業(yè)執(zhí)照副本、稅務登記證（復印件）；
3.知識產權（獨占許可合同）、生產批文，新產品或新技術證明（查新）材料、產品質量檢驗報告、省級以上科技計劃立項證明，以及其他相關證明材料；
4.企業(yè)職工人數(shù)、學歷結構以及研發(fā)人員占企業(yè)職工的比例說明；
5.經具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用情況表（實際年限不足三年的按實際經營年限），并附研究開發(fā)活動說明材料；
6.經具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務報表（含資產負債表、損益表、現(xiàn)金流量表，實際年限不足三年的按實際經營年限）以及技術性收入的情況表。
（三）合規(guī)性審查
認定機構應建立高新技術企業(yè)認定評審專家?guī)?；依據企業(yè)的申請材料，抽取專家?guī)靸葘＜覍ι陥笃髽I(yè)進行審查，提出認定意見。
（四）認定、公示與備案
認定機構對企業(yè)進行認定。經認定的高新技術企業(yè)在“高新技術企業(yè)認定管理工作網”上公示15個工作日，沒有異議的，報送領導小組辦公室備案，在“高新技術企業(yè)認定管理工作網”上公告認定結果，并向企業(yè)頒發(fā)統(tǒng)一印制的“高新技術企業(yè)”。
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